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基因改造的黄豆会导致过敏吗？日前有病人皮肤长出疹疱、发痒难耐，医师诊断应是连续饮用豆浆所引起的过敏反应，并指出可能是“基改”导致，引起广泛讨论。
专长过敏免疫的亚洲大学附属医院副院长蔡肇基认为，此病例应该是针对黄豆本身过敏，基改与否影响不大。他曾针对市面上黄豆进行过敏实验，发现基改黄豆所含的过敏原，比非基改黄豆增加了10%，但仍属于自然变异的范围内，统计上不显著。
但台大农艺系名誉教授郭华仁指出，此一实验结果有其限制，基改技术不只会影响原有蛋白质，还可能产生预料之外的不明蛋白质。
不过蔡肇基坦言，我国基改审议大多是书面审核，由申请厂商自行提供实验报告，再由专家审阅。直到近几年，才有国内专家开始实际进行基改作物的过敏试验和动物毒理试验。
《欺骗的种子》作者杰佛瑞‧史密斯（Jeffrey M. Smith）2012年来台时曾语重心长呼吁：台湾应停止相信美国FDA和基改公司的评估，建立独立的检测机制，才能完全掌控食品安全。
根据卫福部食药署公告，目前我国核可进口的基改食品原料共有130项，分别是玉米69项、黄豆26项、甜菜1项、油菜9项、棉花25项，正在排队审议中的，还有马铃薯和木瓜。
近年消费意识提升，市面上纷纷推出非基改产品，显见民众极为重视基改食安议题。然而面对基改品项与日俱增，民众却只能信任专家帮忙把关，毫无公众意见参与讨论的机制。
进入食药署“基因改造食品管理专区”，虽有审议委员名单和品项清单，但点入“会议结果”选项，却发现纪录只有寥寥数语，例如“案号XXXXX，A公司申请基因改造食品原料查验登记，决议应再补送资料。”毫无参考价值。
非基改公民行动发起人黄嘉琳指出，以目前政府揭露的资料，民众根本无从了解基改审核过程，纵有疑义也无从表达意见。即使是专家也会各说各话，她呼吁政府应效法欧盟EFSA（食品安全局）精神，“所有审议内容都应该公开透明，让所有愿意了解的民众都能取得完整资讯。”
同时她也强调，基改的全面标示必须落实，现在菜市场、早餐店的散装豆腐、豆浆还是有许多没有依法标示，食药署和地方卫生局是否有确实在查验？基改的食安争议短期内显然难以落幕，但民众至少应该拥有知情选择的权力。
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