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石安牧场3月遭最高行政法院判定，虽然卖的是一级农产品鸡蛋，依法不须课税，但因规模庞大、企业化经营而须课税，让不少农友担心“遇农免税”的情形是否不再？
为解决问题，立法院今（4）日提案修改《农业发展条例》，立委提出草案明订，未来有企业化经营、以营利为导向、营业规模“够大”的独资或合伙“农场”，必须向农委会办理登记，前五年可免征营利事业所得税，五年后必须缴营所税。
不过行政、立法双方对于“规模够大”的认定意见分歧，农委会副主委陈吉仲表示，耕作、畜牧、家禽养殖多样复杂，难以用规模划分；但立委蔡培慧认为，新型农场崛起，例如植物工厂等营利事业，若无明订规模课税，是否违反赋税公平原则？同时也可能有不肖公司借由农民人头经营农场，规避课税，因此她主张一定要依规模课税。
以营业税来说，只要农民生产初级农产品、加工品，不论生产规模都可免营业税。而个人综合所得税部分，只要农民符合《农业发展条例》（简称《农发条例》）定义──直接投入农业生产者，因收入被税法视为成本，例如稻作收入30万元，成本即视同30万元，扣除后纯利为零，自然得以免税。
然而今年3月石安牧场却遭最高行政法院判决认定必须缴税，理由是石安牧场因组织型态、资金、场所、设备、人力规模、品牌建立等企业走向，并积极拓展通路与业界合作，有强烈营利目的，和多数免农业税收的理由──“自力耕耘”不同，因而必须纳税。
未来这类在农业现场中有组织、能顾工、以营利为导向，但法律上没有营业登记的农民、组织、企业，都需一体适用课税？为解决这项争议，昨（4）立法院特别在《农发条例》中增订47条之1，要让类似案例有明确规范。
草案明订，只要依新增条文向农委会登记的独资、合伙“农场”，未来需缴营利事业所得税，但在新法修正的5年内，可以免。而哪些“农场”要向农委会登记？则由农委会和财政部自己决定。
农委会副主委陈吉仲说，先前已和财政部向学术界征询意见，发现业者多反对以“规模”作为免税标准，原因在于标准复杂，是要以畜牧业的头数来算，还是耕作面积？或是营业额？若硬性规定有认定上的困难。
不过立委蔡培慧则持担忧意见，认为划设“规模”有必要性。一来是未来农业的确有可能成为赚钱产业，像是太阳能光电来经营的植物工厂、植物农场，“难道可以不用上限的免税吗？”
同时没有划设规模也有让不肖业者借由农民人头经营农场，来规避优惠的可能。而陈吉仲则认为，若订定规模，也有可能会有业者拆成许多小农场来规避管理，因此会再于9月1日、下次会期开议时再讨论。
另外陈吉仲也在现场表示，希望可以将以农民作股东的农业合作社纳入免税范围。不过财政部赋税署长李庆华则表示，合作社纳入“较突然”，还需再进行研议，希望以目前立法院讨论的条文为主，日后如有需要再来讨论。
若《农发条例》九月修正通过，未来农企业若具备公司型态、登记，便以《公司法》管理；而像石安牧场一样未有登记，但符合农委会定义要登记的“农场”，则须办理登记，并可享5年内的营利事业所得税免税优惠，而行政院可视情况决定是否延长免税期间。
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