番茄在秋季设施栽培中占有很大比重，病害是影响秋番茄丰产优质的主要障碍，做好秋番茄病害防控至关重要。
番茄主要病虫害如何防治
灰霉病：开花期可在蘸花药液中加入0.1%的50%速克灵可湿性粉剂或50%扑海因可湿性粉剂，效果很好。也可对果实喷雾，但应注意轮换用药，防止病菌产生抗药性。
病毒病：为秋季设施番茄的突出病害，毒源有番茄黄化曲叶病毒、烟草花叶病毒、黄瓜花叶病毒，田间可因几种毒源混合侵染造成多种病毒病混合发生。应采用遮阳网、防虫网降低棚温及阻隔粉虱、蚜虫、蓟马等传毒害虫;及时中耕，促进根系发育;根据植株及天气情况合理浇水，防止徒长;注意平衡施肥，防止早衰，增强抗病性;田间操作时不要吸烟，整枝打杈时先整健株后整病株，接触过病株的手要用肥皂水洗净;适时采用色板、药剂防治传毒害虫。
生物防治
(一)以虫治虫。自然界中天敌的种类很多，如瓢虫、草蛉、食蚜蝇、寄生蜂、寄生蝇等，它们可以捕食或寄生蚜虫、粉虱、地老虎、棉铃虫、烟青虫的成虫、卵、幼虫(若虫)和蛹。
(二)以菌治虫。如白僵菌、青虫菌、杀螟杆菌、Bt乳剂、农用链霉素、新植霉素、5%的井冈霉素、氯霉素等， 能防治番茄上的多种病虫。
(三)利用黄黏板、黄黏筒、银灰色膜来诱杀蚜虫、自粉虱的成虫。还可利用防虫网，来防治多种害虫。
药剂防治
(一)防治害虫。在害虫的低龄阶段喷药，使用药剂可选择2.5%的敌杀死乳油2000倍液，或200%的速灭杀丁乳油2000倍液，或200%的灭扫利乳油2000倍液。
(二)防治病害。在病害发病初期喷药，使用的药剂有65%的甲霉灵600倍液、50%的多霉灵700倍液、64%的杀毒矾500倍液、58%的瑞毒锰锌600倍液、50%的农利灵1000倍液、50%的敌菌灵500倍液。喷药后应注意放风降湿，并适当控制浇水。也可每亩地用10%的速克灵、45%的百菌清烟剂250～300克，棚内分布8～10个点，用暗火点烧后封闭大棚，熏烟3～4小时进行防治。
保护地番茄土传病害防治措施
(一)菌线威或的确灵夏季闷棚土壤消毒
方法步骤：(1)在保护地番茄收获后春夏之交的空茬时期，气温达35℃以上的高温天气进行。(2)将保护地内田间老株杂草连根清除，将土壤深翻30~40釐米，充分打碎土团。(3)每亩施入0.5~1千克菌线威或的确灵,拌适量细土,均匀撒入地面(注:也可将菌线威或的确灵对水稀释均匀喷于地面)并施入鸡粪、猪粪或其它牲畜粪400~500千克， 然后再耕翻，使粪肥、农药均匀分布于耕作层内。充分灌水，使土壤湿透，用透明塑胶膜覆盖，压实四周，闭棚升温，棚内温度可升至40℃~50℃，在高温、高湿条件下闷棚15~20天。注意事项：a.闷棚时间要选择高温晴天;b.棚膜和地膜密闭程度要好;c.整地品质要细，土团要充分打碎，肥、粪、药、土要充分耕匀;d.处理时要灌足水，以诱发病菌充分萌发;e.处理后的棚室要栽植无病苗，防止有害病虫的再传入。
(二)苗床土壤处理及种子消毒
育苗时，一定要进行苗床土壤处理和种子消毒。(1)苗床土壤处理：每平方米苗床用喷茬克抗病抑菌型可湿性粉剂6~8克，拌入过筛细土15千克，拌均匀，播种前均匀撒入苗床内，耙匀后即可播种， 覆土。(2)种子消毒：可用种子重量0.3%~0.5%的菌成或国优101拌种(包衣种子除外)。通过土壤处理和种子消毒，能有效地防治苗期猝倒病、立枯病、灰霉病等多种病害。
(三)高产栽培要求
在出苗后和快速生长期喷施高效抗病增产剂颗粒丰。颗粒丰是一种对植物生长发育有多种优异性能的活性物质。对番茄的增产和改善品质都有显著功效。从幼果期可每隔5~7天喷施一喷丰1000倍液作叶面追肥。
(四)重茬病害的防治
在番茄移栽前，在整地时施入重茬克，有利于土壤修复，抑制土传病害和线虫的发生。重茬克施用量：标准大棚(6米×30米)，施用重茬克250克，露地每亩用量1000~1500克。最高用量每亩不超过3000克，也可用天诺11号，每亩大田或每个标准棚用2千克。
对番茄的增产和改善品质都有显著功效。从幼果期可每隔5~7天喷施一喷丰1000倍液作叶面追肥。(四)重茬病害的防治
在番茄移栽前，在整地时施入重茬克，有利于土壤修复，抑制土传病害和线虫的发生。重茬克施用量：标准大棚(6米×30米)，施用重茬克250克，露地每亩用量1000~1500克。最高用量每亩不超过3000克，也可用天诺11号，每亩大田或每个标准棚用2千克。
