种子采收后经过晾晒，选出子粒饱满无病虫害的进行贮存。贮藏时要注意分门别类，避免互相混杂。花卉种子的寿命，因种子成熟情况和贮藏条件而不同。有的种子不能贮藏，一贮藏便失去发芽率，如秧海棠等。一般花卉种子的生命力可以保持2～3年或更长时间。贮藏时间太久，不仅降低了发芽率，且发芽后生长力差。
花卉种子的贮存应该注意以下几个方面：
保持干燥保持干燥是防止种子变质的重要条件。含水率应保持在12%，才能使种子的生命活动稳定，一旦发现种子含水率过高，应立即翻晒，以防止其发热、霉烂、受冻。
控制温度高温会使种子呼吸作用增强，直接影响种子的品质和发芽率。在2℃～3℃的条件下保存可降低种子的呼吸频率，从而保持种子有较长的生命力。
环境干净种子贮藏室应打扫干净，用石灰堵塞裂缝和鼠洞，并用石灰水刷墙壁，再以适量化学药剂消毒。家庭养花收贮的种子晒干后可用布袋悬空挂在通风干燥处，这是一种较妥善的贮存办法。
采取不同贮存方法，有的种子适合湿藏，如南天竹、木瓜、桃花、梅花、蔷薇等;而睡莲、玉莲的种子，则需要放入盛水的瓶中贮藏；芍药、月季、桂花等种子需进行沙藏;还有些需要采用冰冻的方法贮存，如鸯尾、飞燕草、水苏等;牡丹、白兰花的种子要随收随种;还有一些核果类和种皮较硬的种子，要贮存在坑内(一层马粪、一层土和一层种子)密封。
