13万违章工厂如何处理？行政院七月初将提方案
争议极大的《工厂管理辅导法》（后称工辅法）第33、34条违章工厂辅导制度，8年来只协助了40家不到的业者成功转为合法经营，到底2020年期限后是否扩大展延办理？行政院官员表示，修法事涉多个机关权责，包括农委会、经济部、内政部、环保署，相关部会正在进行协调中，尚无明确共识。预计一个月内建立跨部会共识并草拟修法版本，7月2日向立法院进行专案报告。
辅导期避免一延再延 中央这次要正视问题
行政院经济能源农业处参议吕贞慧，5月31日在环团抗议记者会接受陈情时说明，“违章工厂就地合法和展延辅导期限，不会是行政院提出的版本。按目前修法的方向，县市一定要提出清理计划，但各县市期程可以再谈。”同在现场的经济部中部办公室科长云瑞龙也说：“经济部会审慎研议，辅导期尽量避免一延再延。”
主责违章工厂业务的经济部中部办公室主任许正宗也说，“可以辅导的工厂，政府会给予协助，无法辅导的还是要关厂。”经济部工业局副局长游振伟则说明，“2016年5月20日以前既存的未登记工厂必须符合三个要件：必须是低污染行业，没有公安疑虑，并有合法缴税，才会讨论处理方案，包括迁厂、关厂，还是辅导合法，希望能够一次制度化解决这个难题。”目前相关法制与政策仍未定案，相关部会将在本月进行密切协商，7月2日向立法院进行专案报告。
污染性违章工厂迁出农地的具体规划是什么？许正宗主任表示，“县市会先进行清查，相关期程、分工也会规划出来，尤其违章工厂问题严重的工业大县，这次行政院不会打迷糊仗，会正视违章工厂的问题。”经济部相关承办则说，“目前明确提出未登记工厂清查的有彰化县和台中市，彰化县计划将对全区26乡镇市做扫街式普查，台中市则是针对筏子溪周边进行地区性清查。”其他县市则是维持有民众检举才会查核的方式。
彰化县林其春科长解释，本次清查属于“工厂管理地理资讯系统数据库建置及系统更新计划”，拟结合辅导措施，调查厂商迁厂意愿，但只掌握资讯，不会涉及后续土地或建筑违规使用裁罚。
环境权保障基金会专职律师郭鸿仪指出，“县市政府依工辅法本来就有调查工厂的权责，只要未完成工厂登记，擅自从事物品制造、加工的厂商，地方应依法处以罚锾，要求限期改善，届期仍不完成工厂登记，可处连续罚到停工为止。”台湾环境资讯协会秘书长陈瑞宾则认为，“甚至已知的违章工厂就应该先进行裁罚，后面查到的可再加进去，不需等到全部清查完才开始处理。”