在食用菌生产过程中，只要根据所选菌种的生物学特性进行管理，就不会出现生理性病害，发生侵染性病害，要按照无公害要求实施用药，以防为主，千万不要随便用药，
长腿菇、不开伞这是典型的缺氧症状，尤其是采用半地下菇棚栽培时，该现象发生普遍，使菇品质量严重下降，影响生产效益：解决办法：加强通风管理，低温季节在上午10点至下午2点时打开通风口及门口，连片菇棚集中栽培时，可予强制性通风，3天左右即可恢复正常生长，不要用任何药物。
攥拳菇、菌褶外翻该现象的发生原因主要有三：一是引进的菌种未经脱毒处理，自身携带某些不明病毒病菌；二是该品种菌株不适应低温出菇。受低温刺激而呈攥拳状；三是在基料内加入了不明成分的药物，或在处理菇棚时或在管理中使用了某些敏感药物，导致子实体中毒。发生该种情况时，应分析自身生产操作过程，如属于菌种问题；则无药可施，只能接受教训，以防再次引进带毒菌种；如属低温原因时，可想法提高棚温，或待气温回升再出菇。药物中毒时，应根据药物品种实施补救，轻度发生时，喷施三维精素溶液可有缓解作用，并可大幅度增产。
麻边菇、瘤盖菇这是典型的冻害症状。原因有二：一是引进的菌株不耐低温，该类菌株在5℃左右即可发生该病症；二是棚温过低，即使低温菌株也难以耐受零下的结冰环境，一般应保持在5℃以上。低温菌株保持在0℃以上即可避免该现象的发生。
黑边菇该症状一般是菌株的遗传性状问题，目前尚无有效的补救措施，只能在引种时到可信单位引好种进行预防。
黄叶菇表现为菌盖发黄、叶片小而薄，严重时整个菌盖表面全部变黄，最后死亡。该病症是细菌性侵染所致，不少人曾经连续使用多种药物，但治疗的效果并不明显，解决办法：清除所有的染病菇体，连喷2～3遍黄菇一喷灵溶液，即可得到抑制。
