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以防疫走上国际舞台台湾公布新型禽流感基因序列获国外重视

综合资讯 作者:农讯网 阅读 0

台湾的禽流感防疫与研究在国际科学界引发关注。美国匹兹堡一位研究病毒资讯的专家亨利‧尼曼博士(Henry L Niman, PhD)分析农委会家畜卫生试验所首次公布的这波新型H5禽流感病毒的基因氨基酸序列(当时H5N8病毒PA基因未公布),与2014年在韩国、日本、欧洲与加拿大等地所发现的H5N8与美国新发现的H5N2与H5N3禽流感病毒比较,认为台湾新型H5禽流感病毒的重组来源更加多元,凸显出此H5亚型禽流感病毒具有非常活跃的重组性。

台湾三株鹅源H5禽流感病毒基因序列较接近日本、加拿大

美国匹兹堡研究病毒资讯的专家亨利‧尼曼博士(Henry L Niman, PhD)图片来源:亨利‧尼曼twitter

农委会家畜卫生试验所在今年一月初公布H5N8、新型H5N2与新型H5N3禽流感病毒株基因序列。根据畜卫所公布的有限病毒资讯分析结果,台湾鹅H5N8病毒株与2014年韩国鸭H5N8病毒株的最相近,H5基因相似度高达(99%),N2与2011年吉林省向海野鸟H5N2病毒株之N2最相近(96%),H5N3禽流感病毒之H5基因与2014年韩国巴鸭H5N8禽流感病毒之H5最相近(98.8%),N3则与2006年日本新潟县鸭H5N3禽流感病毒之N3最相近。

畜卫所认为,台湾这三型新发现的禽流感病毒株H5基因序列彼此间相似性达99.3%以上,且病毒被检出时间相当接近,推测很可能是由“同一批”候鸟携带来台湾。

由于2014年初以来,韩国、日本、欧洲与加拿大等国陆续爆发H5N8禽流感疫情,因此台湾农委会畜卫所将这三株新型H5鹅流感病毒株部分基因序列上网公布后,引发国际间高度重视,远在太平洋彼端美国匹兹堡的病毒研究专家亨利‧尼曼也进行分析与比较。

亨利‧尼曼根据畜卫所上传国际基因库三株分离自肉鹅或种鹅的新型H5禽流感病毒株:云林H5N2 (A/GS/YL/0104/2015)、高雄H5N3 (A/GS/KS/01042/2015)与嘉义H5N8(A/GS/CY/0103/2015,欠缺PA资料),与其他国家发现的H5N8亚型禽流感病毒进行分析,发现台湾分离的这三株病毒的重组来源,与过去在韩国及欧洲所发现的病毒株有所差异,反而较接近日本与加拿大。

也就是说,亨利‧尼曼分析台湾这三株鹅源H5禽流感病毒基因序列虽然都高度接近2014年初从韩国家禽场分离出来的H5N8病毒株,但在演化分支上更接近2014年在日本鹿儿岛从白鹤分离的H5N8病毒株(A/crane/Kagoshima/KU1/2014)以及2014年在加拿大卑诗省从火鸡分离的H5N8病毒株(A/turkey/BC/FAV10/2014),与2014年欧洲爆发高病原H5N8是来自西伯利亚野鸭的病毒株(A/wigeon/Sakha/1/2014)关系较远。

专家:禽流感病毒正不断进行重组、产生新的排列组合 北美亦同

亨利‧尼曼解释,韩国家禽爆发高病原H5N8疫情所分离的病毒株,与一般从野鸟身上分离出的H5禽流感病毒株相较,在HA基因标记S227的位置上已自丝氨酸(Serine,简写为S)产生变异成为一个碱性氨基酸R(精氨酸Arginine),即有S227R的变异。但从2014年韩国巴鸭野鸟(A/Baikal teal/Korea/H96/2014)分离出的另一H5N8病毒株,在HA基因标记227的位置又与一般野鸟分离株相同,并无碱性精氨酸(227R),而仍为丝氨酸(S227)。

亨利‧尼曼指出,经过比对基因序列,2014年欧洲分离的H5N8禽流感病毒株与2014年韩国家禽场H5N8禽流感病毒株高度同源,可推测来自韩国,在HA基因标记S 227的位置均变异为S227R,并推测2014年在欧洲出没的H5N8病毒株是来自西伯利亚野鸭携带的病毒株(A/wigeon/Sakha/1/2014)。不过,日本鹿儿岛、加拿大卑诗省分离出的H5N8病毒株之HA基因标记227的位置仍为S 227,却与韩国家禽场与欧洲分离的H5N8病毒株均有所差异。

他进一步分析,日本鹿儿岛H5N8病毒株的8段基因序列已产生变异,在演化分支上自成一格。特别的是,台湾这波在家禽鹅身上发现三种亚型的H5(2.3.4.4)病毒株基因序列,却同时出现S 227与S227R,意味着病毒重组来源有二:一为来自韩国家禽的H5N8病毒株,但也有来自于野鸟;且台湾H5N8病毒株从官方释出的7段基因序列分析,就有PB1与NP两段病毒基因来自野鸟,明显与韩国家禽场的H5N8有所不同。

另外在新型H5N2的部分,亨利‧尼曼根据台湾官方上传的基因库资料,说明8段基因序列当中有5段(PB2, PB1, PA, NP, N2)来自于野鸟,另外NS基因序列有时也与野鸟吻合,显示台湾新型H5N2病毒株的重组来源可能至少有两种不同来自韩国家禽与野鸟的排列组合,也就是8段基因序列当中,来自韩国家禽或野鸟的组成比例可能为2:6或3:5的两种不同组合。

除了台湾发现新型H5N2,美国2014年底在华盛顿州进行野鸟监测时,也在针尾鸭发现新型H5N2 病毒株( A/Northern pintail/Washington/40964/2014),经过基因序列分析,发现在演化分支上跟韩国在豆雁身上发现的H5N8高度接近,也就是在HA基因标记的位置上也出现S227R,显示北美至少有两个不同演化分支系列的新型H5N2禽流感病毒在循环。

亨利‧尼曼指出,目前台湾有三种H5亚型禽流感疫情散播,甚至有水禽场同时被检出两种H5亚型禽流感,这显示禽流感病毒正不断进行重组而可能产生新的排列组合,同样的情形也正在北美发生。

从亨利‧尼曼的分析显示,农委会畜卫所释出其他台湾禽流感病毒基因序列仍有急迫性,未来仍须释出每个县市不同禽种首次分离得到的H5N8、H5N3、新型H5N2与旧型H5N2四种禽流感病毒,以及早供各界讨论因应防疫作法,并且让台湾的疫情经验走向国际舞台,受到重视。

亨利尼曼博士研究的原文出处http://www.recombinomics.com/News/02021501/H5_Taiwan_BC.html

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