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行政院与农委会今上午召开禽流感中央灾害应变第五次会议，基于最后一例发病时间距今已两个月，因此决议撤除应变中心，将防疫工作回归常态；对此，农委会指出，为了降低H5N2及H5N8疫情，并且避免让H5N6病毒在地化，将持续推动密闭式和非开放式养殖模式，并规划理货场以减低不同禽场家禽间的交叉感染。
对于此次疫情是否告终，行政院院长林全指出，此次政府是“安然度过无声战争、顺利完成考验”，工作结束我们应该感到庆幸；另外，有鉴于去年日韩疫情的大爆发，台湾整体情况较佳，可归功于整体的政策目标明确，当时禁运七天的决策用了很大勇气，但是十分正确，另外蛋鸡肉鸡未全面禁止，也有效减缓市场冲击，这部分农委会值得鼓励，现在虽撤除灾害应变中心，回归常态运作，但政府还是会继续保持警戒。
农委会主委林聪贤指出，此次各部会都动员了不少人力，加上提高通报扑杀补偿、实施禁运禁宰及鸭只上市应检附检验报告等措施，成功让疫情获得控制，最终H5N6禽场案例仅12场、扑杀4.1万只家禽，与韩国H5N6疫情在3个月内出现近900场、扑杀3千多万只家禽相比，台湾属于低度疫情。
林聪贤也表示，最后一起案例发现于3月6日，至今已经超过两个月都没有新案例发生，才会达成共识将防疫回归常态，至于外界担心H5N6是否演变为在地化，他则强调，现阶段无法断言，将于近期召开专家会议，由专家来评估。
同时，农委会指出，后续禽流感各项监测及防疫还是会持续运作，在视察了诸多交易情况后，未来将规划理货场以减低不同禽场家禽交叉感染的风险，并要求防检局旗下四个分局与地方政府合作，针对没有畜牧场登记证的禽场进行查缉，预计一个月就要完成上百场稽核；此外，也将调整产销模式，逐步辅导业者转型为密闭式或非开放式养殖，并建议业者避免将鸡只老中青三代混养，缩短土鸡出货时间以减低感染。
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