危害蘑菇的“三虫一病”是：螨虫、跳虫、菇蚊、有害疣孢霉。现将这些病虫害的症状及防治方法叙述如下。
蘑菇病虫害
一、螨虫：发菌过程中，如菌丝有退菌现象，如蘑菇绒毛状菌丝减少，索性菌丝增多，菌丝表层有粉红发亮点，则为菇床有螨头。当用放大镜所看到的范围内有3~5只螨虫时，即达防治指标。覆土后螨虫会随菌丝向土面生长而向土面移动，集中取食原基和菇柄基部，造成蘑菇根部光秃，无菌根，营养无法输送而死。同时螨虫传播病菌和病毒，螨虫严重的，各种病害也严重。
二、跳虫：跳虫是杂食性昆虫，种在大田、大棚内的蘑菇，跳虫较多。常见的有灰白角跳虫和体型微小的黑角跳虫。跳虫取食菌丝也取食菇体，常聚于菌褶内或菇盖上，咬啮菇体，造成菇体干缩死亡。尤其是黑角跳虫，虫子体细微，虫口密度大，易造成毁灭性灾害。
三、菇蚊：温度逐渐降低的秋季适合菇蚊和菇瘿繁殖，尤其在粪肥丰富和发酵不彻底的培养料内，菇蚊和菇瘿数量庞大，幼虫取食菌丝。降低产量，如菇蚊爆发，群体数量过大，也可引起毁灭性灾害。
四、有害疣饱霉：当菌丝在土中处菌素形成期，原基分化期和子实体生长期均可被有害疣孢霉侵染。菇体被害后，表现畸形，菇柄膨大，菇盖变小，并附白色绒毛状菌丝，后变褐，有褐色液或病斑，菇体被害后，蘑菇产量和质量都遭损失。
五、病虫害综合防治：
在发菌中后期，培养料中虫口密度达防治指标时，需及时用药，应选用高效低毒且对菌丝和菇体无伤害的农药。菇房条件好，密封性强，可用磷化铝熏蒸，每立方米3片(9.9克)密闭48小时。大多数菇房或棚地只能用药剂喷雾，菇虫净是专用于食用菌杀虫杀螨的生物型药剂，具有内吸和胃毒作用，在虫口密度大时，用500倍喷雾；在覆土期发生虫害，可在覆土后，结合重施调菇水时，在水中配1000倍菇虫净；在第一潮菇生长期的虫害，应在第一潮菇高峰期后，用菇虫净防治。用药前视菇房湿度停止浇水1~2天，使药剂能更快吸收到菌床深度，达到杀虫效果。
当菇床上出现被疣孢霉侵染的蘑菇后，应停止喷水2~3天，保持床面干燥，及时摘除病菇并烧毁，待这潮菇过后，立即喷1000倍多菇丰杀菌剂，结合补水，隔3天喷1次，连喷3次，可有效控制土层病菌蔓延，同时注意控制空气湿度，加强通风。
