新建池塘，经水浸泡1~2天，然后进行消毒。老塘必须排干水后，彻底清除污泥和杂草，采用翻耕暴晒及冲洗等办法促进有机物的氧化、分解和排除，最后再进行消毒。
常用消毒剂有生石灰、漂白粉、二氯异氰尿酸钠。消毒方法一般先将养殖池注水10~30厘米，消毒剂溶于水后，泼入池中。水泥池用药水多次冲洗，然后再用清水冲洗。如某企业养殖南美白对虾消毒在放苗前15~20天进行，池塘进水10~30厘米，用漂白粉41千克/亩、强氯精8~10千克/亩溶水后泼洒池塘。2天后排干池水，用生石灰100~150千克/亩，全池泼洒，进水浸泡2~3天，然后排干池水再进水20~30厘米，每亩用茶子粕浸泡后连渣全池泼洒。
养殖水体施用肥料是补充水体无机营养盐类、提高水体生产力的重要手段，但过量施用则可能会使养殖水体的水质恶化和污染环境，造成天然水体的富营养化。施肥主要用于鱼、虾、贝类的池塘养殖和海带、紫菜等大型藻类的养殖。有机肥的使用应经过发酵、腐熟、消毒、杀菌等处理，禁止使用未经处理的有机肥，不得使用未经国家或省级农业部门登记的化学或生物肥料。
养殖池彻底清塘、消毒后，可施肥培育浮游生物。当池塘内已有丰富的饵料生物，且水质达要求时，就可以准备放苗了。
