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农委会育种经费连三年狂砍，每年往下调降一千多万，到今年（2016），育种经费剩不到一亿五千万元；其中用在杂粮的用种经费更从两千五百多万一路下滑到一千七百多万。今年连续两次强台，造成云嘉南大豆产地严重积水，这一期秋作几乎全军覆没，农友呼吁政府应投入经费，培育耐受环境力强的杂粮品种。
农委会副主委陈吉仲表示，明年育种预算将回到一亿八千万的水平，但除了经费问题，过去为因应政府组织改造，农改场“缺二补一”长期人力不足，，如何让人钱到位进行育种工作，有待考验。
今（18）日立委蔡培慧召开记者会，与会高雄农民侯兆百、云林农民黄祈尧、云林农民蔡得黄、台大农艺系退休教授郭华仁共同呼吁政府重视杂粮育种；蔡培慧更喊出要求“杂粮育种预算提高两倍”，并培育耐雨、耐旱等环境耐受力高的杂粮品种。
蔡得黄表示，连续豪雨让黑豆、黄豆田都泡在水里，就算现在重新种植也无法销售。希望政府在育种上多施一点力，“种是自己的，才能跟别人拼。 ”
在高雄旗山种植220多公顷的毛豆农侯兆百也表示，今年台风来时正值毛豆出芽期，豆苗因泡水而无法继续生长，“未来毛豆种源肯定不足！”再加上这两年因极端气候，导致毛豆供货不稳定，“外销国际，看的是稳定度。”供货不稳将冲击销售通路。
侯兆百更表示，以前是区域性灾害，现在因为极端气候，常常都是全面性灾害，若育种经费不足够，难以支撑大规模耕种。
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