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上周公布新科中研院士，其中中兴大学土壤环境科学系教授杨秋忠也在榜上，是入选名单中唯一农业相关的学者。
杨秋忠自1980年代从美国夏威夷大学学成归国后，便致力钻研将微生物作成肥料，然而受限于当时流行的化肥农药，经费有限，重视度亦不高；然而事过境迁，他的研究不仅符合当前友善农业趋势，还发现、命名出117株新微生物，建立有6000多株菌种的“菌种库”，是全台之冠。
一般人或许对杨秋忠教授陌生，但他所执笔的参考书《土壤与肥料》，是马来西亚有机肥料业者的商业圣经，已再版9次，他也参与农改场进行有机肥料试验，并和农友座谈超过600场，分享合理用肥的知识。
虽然事后这样的产品的确开发出来，只是回想30年前刚学成归国，在土壤年会的场合上提出理论想法时，却遭资深学者“打枪”，隐约暗示他“微生物做成肥料”的想法恐怕太异想天开。但他苦笑说，“我学植物，又学土壤、微生物，当我看到台湾这样依赖化肥，知道一定会造成生态、病害、虫害的问题，所以即便困难还是非做不可。”
然而筛选菌株其实相当不容易，“毕竟不是肉眼看得到，真的只能碰运气。”杨秋忠说，通常都是在农友田间发现只有某区某作物长得特别好，便开始采土作分析，只是他还会想办法撷取一段根系，看是否有细菌附生，他笑说“这是做研究的眉角（窍门）。”
从土壤中分离出菌株后，接着便是进行纯化、鉴定，若过去有人发现过这只菌株，便参考前人的分析结果，再拿自己的菌株操作一遍，看哪个效果佳，“一定要拿来PK一下！不然自顾自地拿来做实验，发现固氮、溶磷效果很好，却发现别人菌种库的更强，研究不是白搭了吗？”
而在PK赛胜出的菌株还不一定能商业化，杨秋忠说还得测试它的“适应力”。像毛豆便有高雄6号、7号、8号等许多品种，但每一种固氮菌进行的固氮反应并非每种毛豆品种都能充分利用，得实验、分析出最佳组合才能有效。
最后把微生物肥料作成商品后，还得考量在架上周转的时间，如果微生物一个月便死掉，那农友买到是超过制造时间一个月的产品，便形同买到“死菌”，自然效果不佳。
简言之，要筛选、组合出大宗作物都能适用，又能普遍是应在各种酸碱度、温度，还活得长久的微生物，前后耗费时间10年以上都是在所难免。
也由于耗时冗长、人类需求又多，不少人选择以“基因克隆”方式，将符合种种要件的基因片段从微生物中取出、转植。然而杨秋忠说他自始自终都反对这样的方式，因为难以确保当前科技取出的基因片段“够纯”，很有可能在操作过程中额外取到非目标物质，实验结果便会造成极大的生态风险。
其实杨秋忠不仅在中兴大学执教鞭近乎40年，期间更是研究、著作等身，《土壤与肥料》一书更是该领域的基础专业教科书，目前已经再版第九版，他笑说书商都请他继续更新，但一直没有时间处理。而这本书更是马来西亚的生物有机肥料公司的“商业圣经”，也意外为中兴大学赚进额外奖学金。
现如今他当选为中研院第31届院士，虽然是荣誉衔、无给职，但可说是国内学界的最高荣誉。而他不只是中兴大学农学院首位获得殊荣的学者，也是该校第一位院士，但他仍笑说，农业好不容易受重视，仍会继续努力。
由于传统堆肥都须让微生物在2到3个月内才能完全分解，许多中小学师生也都反映处理过程相当困难，在科技部的经费挹注下，杨秋忠特别找到可以快速分解的菌种。只要利用机器将校园内落叶残枝打碎，添加酵素、加温杀菌后，每9立方米的原料可制作出1.5立方米的有机肥，作业时间仅3小时半，肥料含量有85%的有机质，氮、磷、钾分别含1%、0.7%、0.5%，制作过程也公布在网络上。
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