菊花病害主要来源于花土、旧花盆、扦插条、种子和幼苗，所以在种植前应对土壤进行暴晒，或用1誜80的福尔马林液对土壤和花盆进行消毒，或在土壤中混进一定量的代森锰锌。扦插、移栽前，用800倍至1000倍多菌灵喷一次。下面介绍菊花定苗后几种常见病害的防治方法。
斑点病也叫叶斑病，主要靠土壤传播。侵害初期，被害植株叶片呈黄色和暗褐色的圆形或椭圆形斑点，随后病斑中心出现小黑点，基叶发黄、干枯，上叶、花蕾逐渐发病，影响开花。该病害在连日阴雨、潮湿积水、昼夜温差大时易发生。防治办法有：合理换茬种植，并选用无病毒植株嫁接；忌多施氮肥，注意排水通气，浇水时避免泥水沾到叶面，及时去除病叶；用80%可湿性代森锌500倍液或1%波尔多液，每月施用2至3次，发病时一周施用一次；移栽幼苗时，用高锰酸钾或福尔马林进行消毒。
白粉病寄主休眠芽带菌，主要在中上叶正反面。初期为黄色斑点，后为粉霜状物，逐渐扩大后连成一片，成为大面积的白色粉状斑，严重时叶片和嫩梢卷曲变形，甚至凋萎致死。该病害多发生在8月至10月。防治办法有：清除越冬杂草，合理浇水施氮肥，防止猛长突发；整枝打叶，保证通风透光；用多菌灵预防，也可用1000倍退菌特液喷洒，或用0.3至0.5度石灰硫磺合剂喷洒，数量少时用食用醋喷洒也有一定效果。
锈病来源于种子和杂草，主要危害菊花叶和茎，以叶受害较重。病斑灰白突起小点，随后病斑由叶背透过叶面裂开，有枯黄色病菌粉，可随气流传染，后期斑点变黑。该病害在雨多、湿度大时易发生。防治办法有：合理施肥，适当增施磷钾肥，提高植株的抗病力；盆栽菊花要经常疏通排水孔洞，严防盆内积水；除杂草，及时除病叶，保证通风透光；在多雨季节，施用65%代森锌500倍液或波美0.3至0.5度的石硫合剂，可有效防治该病蔓延，也可用托布津、多菌灵预防。
根腐病根系腐烂，呈干腐状或乱麻状，叶片枯黄凋萎。多发生在开花前后。防治办法有：适当灌水，涝排旱灌，疏松土壤；大蒜水灌病株根部，施速效肥有一定效果。
病毒病主要由蚜虫、绿盲蜻传染病毒。植株幼嫩部皱缩、变形，出现“柳叶头”、“黄花叶”，很难治愈。防治办法有：选无病株枝条、种子，利用根尖、茎尖无病毒组织组培苗；早去“柳叶头”，利用侧枝开花，防治蚜虫。
